2017/3/11

迴歸的基本假設


均質性與常態分配



若 Y 是某校學生身高,X 是學生年紀(19-22),均質常態可以想成 19、20、21、22 每一個年紀對應的身高分配,曲線都是變異數相等的常態分佈。


存在性

每筆資料的 X 都可對應到 Y,Y 的平均值與標準差存在且有限

獨立性

每筆資料互相獨立


線性

X 與 Y 呈線性關係

2017/3/1

信度和效度


高中軍訓有一堂實彈射擊課程,到軍營裡體驗打靶,還記得當時分數不高,彈孔全部偏到了靶紙的左上方。沒想到教官後來想找我參加射擊比賽,根據他的說法,選擇的標準不盡然是成績,而是看彈孔的集中程度。

教官的邏輯是,找出那些每次都可以打到定點的選手,再修正他們的瞄準位置,會是比較理想的訓練方式。直到學了統計和研究方法,才赫然發現這其實就是信度的觀念,換句話說,信度高代表結果再現性高。


2017/2/20

塊狀隨機分派


有一個研究,分成 A、B 兩種介入方式,要將 100 個病人隨機分派至兩組。


簡單隨機分派


使用亂數表,產生 100 個數字,奇數時將病人分到 A 組,偶數時將病人分到 B 組。

優點是很簡單直覺。缺點之一是 A、B 的數量可能不平均,比如 55:45;缺點之二是 A、B 的排列可能不夠散,例如 AAAAAABBBBBB...。

為什麼 AAAAAABBBBBB 這種分派方式可能會有問題?如果病人的來源是門診,從早上開始收到晚上,那一大早會來看病的人比較容易進入 A 組,晚上才來看病的比較容易進入 B 組。這樣兩組之間,因為隨機分派造成基本條件相近的優點,就不易顯現。

2017/2/15

成人疫苗總整理


醫學生時考小兒科,最痛苦的部份就是背疫苗時程表,還記得老師半開玩笑說:「等你們有小孩就會記得了」。不過即使現在有小孩了,因為疫苗不斷進展,時程表常常修訂,所以還是要查資料才能確定。

進入家醫科,我才知道成人有那麼多種疫苗(口訣:肥蛇腦子沒 Apple 流鼻水)。本文參考疾管署家庭醫學會建議,做個總整理,實際需要的通常比圖中少,因為可能已有保護力,或感染風險低而不用打。

2018 年 1 月 CDC 建議更新 

2017/2/10

相關與迴歸


X,Y 的緊密程度
圖形越,係數越高

X 每增加一單位,Y 的變化程度
圖形越,係數越高

值得注意的是,相關和簡單線性迴歸的檢定方法是相同的,所以 p 值會一樣。

2017/2/5

再會 老教科書


農曆年整理藏書時,對著滿櫃子的教科書發愣。

每本書都代表了醫學生時的一場挑戰,至今想起仍感到慶幸,自己熬過來了。坦白說,由於進度壓力緊湊繁重,大部份的考試其實都是依賴共筆、講義、考古題度過的,擺在案頭的教科書比較像是一種安慰的圖騰,一種和學術殿堂的連結。

理智上,知道以後應該不會再去翻這些書,畢竟真有需要查閱相關知識,應該要上網找最新資料,而不是這些十幾年前的東西。但是情感上,卻又有點不捨,總覺得就這樣丟棄,似乎那些辛苦走過的日子,就什麼也不剩了。

2017/2/1

安全的簡報格式


曾經準備一場演講時,到會場才發現主辦單位的 PowerPoint 版本太舊,即使內嵌了字型,仍然無法正確顯示,所幸有另外準備 PDF 檔,才沒出糗。

從此之後,我改變作法,把每張投影片都轉成圖片,再一一貼進新的簡報檔,很安全不容易出狀況,不過坦白說做起來挺費事的,直到我發現這個選項:

圖片簡報



2017/1/25

直方圖不是長條圖


直方圖

  • X軸是連續變項
  • 長條的寬度有意義
  • 長條之間沒有空隙

長條圖

  • X軸通常是類別變項
  • 長條的寬度不具意義
  • 長條之間有空隙

2017/1/20

學術論文怎麼寫?



研究各期刊發表需知時,找到一段珍貴的演講錄影,投影片摘要如下:

基本概念

  • 為什麼要發表論文
    • 理想上,是改善全人類的健康照護品質、享受貢獻知識的喜悅
    • 現實的考量,是為了得到研究經費、求職、升遷,或保住飯碗

2017/1/15

手機同步信心螢幕



演講時該看哪裡?


我的心得:注意力放在觀眾,需要引導視線時和大家一起看投影螢幕。

講述內容時,看著觀眾會有比較好的互動氣氛;播放影片或指出畫面重點時,和大家一起看投影螢幕會比較自然。

2017/1/10

先寫後編


簡報製作有一個很實用的技巧:便利貼法。在打開電腦之前,就用一疊便利貼,寫下靈感、勾勒出要講的每個重點,並加以排序,全部完成再開始製作投影片。實際操作過,覺得非常實用又有效率。

研究所開設的學術英文寫作課,介紹了類似的技巧:writing & editing,越聽越覺得和便利貼法異曲同工。


2017/1/5

暈針


記得大學的檢驗醫學課程第一次拿針筒,同學們兩兩一組互相抽血。有幾個人針一扎,瞬間臉色慘白,在座位上趴下去,嚇壞大家了。不過助教倒是司空見慣,量了血壓,笑說休息一下就好。


2017/1/1

中央極限定理



丟骰子


丟一顆六個面的公平骰子,記錄每次出現的點數,重複無限多次,將出現次數對出現點數作圖,可以得到六個長條,每條等高。

將骰子增加到 10 顆,記錄這 10 顆骰子出現的所有點數取平均值,重複無限多次,將出現次數對點數平均值作圖,可得到左二圖形,左右對稱,中央約等於 3.5。

將骰子增加到 30 顆,然後 90 顆,可發現骰子數目越多,每次丟完之後所有骰子出現點數「平均值的分配」越向中間值 3.5 趨近。

2016/12/25

青壯年的肺炎疫苗


我的耶誕禮物


即使沒有特殊適應症,在醫院裡工作,多一分保障總是好的,所以耶誕前夕,用一種買保險的心情,我接種了肺炎疫苗,投資未來的健康。

個別化的專業判斷,優先於現有臨床指引,不只疾病的治療如此,對於預防疾病用的疫苗,我也是這樣想的。在仿單允許下,應儘量找出最有利的選擇。


2016/12/20

夠了



這本書記錄了約翰伯格創立 Vanguard 資產管理公司的緣起,與他的經營理念和人生哲學。其實關於本書的介紹,看綠角的書評已經夠了。

我最感興趣的部份是他引用的這篇論文,提出自我實現理論的三個評估層面,三個都不是金錢:
  1. 自主權(autonomy)
  2. 與人交流(relatedness)
  3. 發揮能力(competence)
突然發現,寫網誌明明無償,卻覺得開心,其實是有道理的。我可以自己決定要寫什麼、怎麼寫;文章發表之後,與網友們的互動可以帶來不同的收穫;而書寫過程,也是文字運用、美學創作的能力發揮。

2016/12/15

十本疫苗期刊


(前情提要:系統性篩選疫苗期刊

搜尋過去五年 PubMed 上刊登疫苗論文數量前十大的期刊後,研究每本期刊屬性,以找出最適合的學術社群。

先說結論:IDSA 的 CID 和 JID、Vaccine、PLOS ONE,較適合我的臨床研究屬性。

2016/12/10

觀察性研究的三張表


醫學領域典型的觀察性研究,是分析自變項 X 和依變項 Y 之間的關聯,通常會依 X 的不同而分成兩組(或多組)。標準的呈現方式包含三張表:

表一


介紹各組之間,變數的特質和分佈。連續型變項會使用 "平均值(標準差)" 的方式表達,類別型變項則使用 "數目(百分比)" 的方式表達。

2016/12/5

帶狀疱疹新疫苗


我在這間負壓隔離病房過了七天。


我得了水痘。發病前幾週,接了一個臉部帶狀疱疹的住院病人,她張開嘴巴,半邊的舌頭上密佈了潰瘍和結痂,痛到不想開口講話,只用點頭搖頭回應。寫病歷時,心裡閃過一個念頭:我沒得過水痘,要不要趕快去接種疫苗?

2016/12/1

ANOVA 變異數分析



  • 目的:比較三組以上的平均值差異
  • 基本前提:
    • 各組呈常態分佈,或各組樣本數大於等於 30(否則要改用無母數檢定 Kruskal-Wallis test 比較中位數差異)
    • 各組的變異數相同(否則要改用 Welch ANOVA)
  • 方法:比較組內變異和組間變異
    • 如果組內變異小,組間變異大,代表各組的平均值不全相同
    • 至於誰跟誰有差,則需要進一步做事後檢定(post-hoc analysis)才知道
  • Post-hoc analysis(ANOVA 顯著時才需要做)
    • LSD with Bonferroni adjustment:新 α 要除以(C 組數取 2)
    • 軟體提供的事後檢定方法,都可以試試看,找出能區分差異的兩組。方法包含 Scheffe,Tukey-Kramer,Duncan,Student-Newman-Keuls,Sidak 等等

2016/11/25

無母數檢定


  • 較不易做出統計顯著
  • 不用管樣本的分配如何,都可以用
  • 把連續變項的數值用名次取代,進行分析
  • n < 30 且未通過常態分配檢定時,改用無母數統計
  • SPSS 使用的是 normal-theory method,前提是 n ≥ 16
  • 如果運算後(例如取 log 後)變成常態分配,那就運算後做母數檢定

2016/11/20

Paired t-test



配對有兩種

  • 同一個體
    • 不同時間(治療前後)
    • 不同部位(左右手)
    • 不同型態(肝臟和腎臟)
  • 不同個體
    • 有某種相似的配對依據(雙胞胎、夫妻)

Paired t-test

  • 因為結果可以用一個改變量來表示,所以其實就是單樣本 t 檢定的一種
  • 重複測量的結果改變量要可靠,前提是 baseline 條件一致
    • 反例:菲爾普斯和旱鴨子一起上游泳課,比較進步程度

2016/11/15

黃熱病疫苗終生有效


高雄市小港醫院是旅遊醫學合約醫院之一,由於鄰近航空站和海港,有不少外籍船員會來接種黃熱病疫苗。是他們都有良好的防疫觀念,懂得防患未然嗎?

說穿了,背後原因很單純,這是 WHO 明定於 2005 年國際衛生條例 IHR 2005 的。


2016/11/10

Independent t-test



  • 用於比較兩組連續常態樣本的平均值差異
    • 每個樣本必只屬於其中一組(獨立)
  • 適用的前提是兩組成常態分佈,或兩組的樣本數皆大於等於 30
  • 兩組標準差是否相同會對應不同結果,要先檢定
    • F test p-value < 0.05:兩組標準差不同(unequal variances)
    • F test p-value ≥ 0.05:兩組標準差相同(equal variances)

2016/11/5

如何了解一支疫苗


以臨床醫師的角度,我通常使用這些資源研究疫苗:

仿單


仔細看過一遍仿單,其實就等於瀏覽過產品的藥理學、重要研究、適應症、禁忌症、劑量用法,非常有效率。

CDC



2016/11/1

95% 信賴區間



正式解釋


從母群體中重複抽取 n 個隨機樣本,「樣本平均值的 95% CI」會有 95% 的機率包含母群體平均值 μ

影響因素

  1. 樣本數量 n 越多,CI 越小(可以作出較精確的估計)
  2. 母群體 SD 越大,越分散,CI 越大
  3. 如果不是取 95%(α=5%) 而是 99%(α=1%),CI 更大

2016/10/25

王浩威:一場自我追尋



日期:2016.10.03
地點:高醫演藝廳
講者:王浩威 作家/精神科醫師
主題:探索自我,找尋到真正的人生目標

對王醫師神往已久,但這是第一次現場聽他演講。他以親身經驗出發,對在座的學生暢談自己的生命追尋歷程。其中最讓我印象深刻的是幾句話:

2016/10/17

我的品牌色


深紅作為簡報品牌色已經一年了。


一年前參加了新思惟的醫學簡報課程,那時候交出一份以深藍為主色系的課前作業。講師蔡校長建議換個色系,避免以老人為主的目標觀眾族群,覺得不吉利。這個建議相當細膩,色彩心理學的效應都考慮到了。

2016/10/16

SAS 程式設計師


這是我最有趣的一張證書:


考這個完全出自興趣。先通過基礎程式設計師的考試,然後參加官方集訓課程,再到 SAS 台灣總部通過電腦化測驗,就能取得證書。測驗分成三大主題:

  1. SAS SQL 1:資料庫處理常用的 SQL 語法
  2. SAS Macro Language 1:用程式寫程式
  3. SAS Programming 3:增進資料處理效率的方法

2016/10/10

蘋果橘子創意百科


蘋果橘子


這一系列的書已經出第四本了,照例中文譯名和英文八竿子打不著 XD

第一本是「蘋果橘子經濟學
(怪胎經濟學;Freakonomics)
第二本是「超爆蘋果橘子經濟學
(超級怪胎經濟學;SuperFreakonomics)
第三本是「蘋果橘子思考術
(像怪胎般思考;Think Like a Freak)
第四本是「蘋果橘子創意百科
(該何時搶銀行;When to Rob a Bank)


2016/10/5

系統性篩選疫苗期刊


新思惟醫學論文與寫作工作坊有一堂課是討論期刊的選擇策略。坦白說在這之前,我並沒有系統性分析過合適期刊,只知道幾本常見的,所以給自己這篇課後作業。

搜尋 PubMed 策略



2016/10/1

誤會你了,EndNote



國高中時對程式設計很有興趣,自認為帶有一點 geek 的血液。所以在自學 EndNote 時不順利,直覺的想法是這個軟體不太使用者友善。

直到這個禮拜,好好聽過一遍圖書館辦的講座,才兩個小時就完全改觀,明明就很方便好用啊!對不起以前都誤會你了,寫篇網誌賠罪。

2016/9/25

藥物治療學



這門課由資深醫師講授藥物的臨床使用重點,是我進研究所最期待的課程之一。

第一堂課,一口氣聽完三小時的精神病藥物治療,邊聽邊用電腦整理重點筆記,感想只有四個字:非常過癮。

學生時沒有臨床基礎,再加上初次接觸,藥學知識顯得生硬;進入臨床工作,大家都忙,沒有人有義務或時間系統性再教你一遍,都是從實際經驗中慢慢摸索,一個藥一個藥累積使用經驗。偶爾遇到熱心的老師提示臨床重點,都萬分感激。

有機會好好複習統整臨床藥學知識,真覺得非常珍貴。

2016/9/20

類別和連續變項


以前對統計的印象,就是很多公式,很多數學,但實際要應用時還是不知所措。

後來慢慢懂了,其實可以純粹站在應用角度學統計操作,背後原理推導以一種欣賞的心情去了解就好。更簡單地說,辨認出自變項和依變項的性質,清楚要問的問題,就可以找出對應的分析方法。

所有的變項可以先分成類別(categorical)和連續(continuous)兩種:


2016/9/15

B型肝炎抗體陰性,然後呢?


門診常遇到對 B 型肝炎檢查結果感到困惑的民眾。的確,一堆陽性、陰性的報告常讓人糊塗,甚至緊張。到底什麼時候該打針,什麼時候要定期追蹤,什麼時候要小心不被傳染?

先說結論:唯一需要補接種疫苗的狀況,是以下三者皆為陰性的高危險群者。


2016/9/10

十場英語演講


2015 年,幸運得到哈佛短期進修的機會。確定申請通過以後,其實有點焦慮,因為對英語溝通能力沒有把握。於是我參加了國際演講會(Toastmasters International)

練功升級


其實這個社團的核心不是練習英語會話,而是上台演講。每兩週一次的聚會,有固定的行程表,通常由演講、即席問答、評審回饋、文法建議四個單元組成。社員依照訓練手冊的要求,準備數分鐘的英語短講,也會輪流擔任主持人和評審。

制度的設計有一點像電玩練功,每完成一場演講,就多一些經驗值,從新手逐步升級。第一次的晋級條件,是完成 "勝任溝通" 教材手冊裡的十場演講。加入將近兩年後,我終於完成這個任務。


2016/9/5

黑天鵝效應和疫苗



黑天鵝事件是指出乎意料、完全不在預期的新事件,具有三個特性:

  1. 稀少性和離群值(outlier)
  2. 帶來極度衝擊
  3. 事後諸葛的解釋(而不是先見之明)

2016/9/1

Google Play 圖書


自從 2015 年 4 月在 Google Play 圖書買了第一本電子書,至今也一年多了,平均每個月一本。結論是:未來買書,會以電子書優先。


2016/8/25

隱形的自我設限



剛拿到 Toastmasters International(國際演講會)2016 年世界冠軍的 Darren Tay,來自新加坡,是第一位得到冠軍的華人,也是史上最年輕的冠軍。

2016/8/22

從主播染瘧疾談起


英國美女體育主播 Charlie Webster 在參加里約奧運開幕典禮後感到不適,原以為是脫水問題,到醫院打點滴,想不到病情逐漸惡化,才發現感染了瘧疾,住進加護病房治療。

在國外旅行時,要怎樣避免感染瘧疾?

瘧疾有疫苗嗎?


目前還未上市,但是快了。第一支瘧疾疫苗已於 2015 年通過歐洲藥品管理局核准,這是一支重組蛋白疫苗。

在疫苗上市之前,預防瘧疾只能靠持續不斷服用抗瘧藥物、以及避免瘧蚊叮咬。

目前怎麼預防?


預防瘧疾的藥物有以下幾種選擇,都是出發前就要開始吃,旅途中繼續吃,回國後還要吃。奎寧(quine)類的藥物都是每週一次,所有藥物除了 Atovaquone/Proguanil,其他回國後都要吃滿四週:


2016/8/15

第一支登革熱疫苗



登革熱有四型


登革熱病毒分成 DEN-1/2/3/4 四型,感染後對該型終生免疫,但仍可能被其他型感染。針對登革熱的治療都是支持性療法,給退燒藥和點滴,觀察嚴重併發症。疫苗的出現,有機會改變目前的疾病生態。

疫苗上市


2015 年底,第一支登革熱疫苗通過臨床試驗,在墨西哥、巴西、薩爾瓦多和菲律賓取得上市許可。這是一種活性嵌合病毒疫苗,用黃熱病毒疫苗為骨幹,分別嵌合四型登革熱病毒前膜蛋白(preMembrane)與套膜蛋白(Envelope)基因,接種年齡為 9-45 歲,接種 3 劑(第 0/6/12 個月)。

孕婦不能用


活性疫苗的限制之一,就是有可能通過胎盤傷害胎兒,因此孕婦不能接種。不活化型的疫苗(如 DNA、次單位、去活化疫苗)仍在研發中,或許未來有機會問市,提供更安全的選擇。

2016/8/13

說話的力量



這本 TED 官方指南堪稱上台演講的百科全書,從基礎、工具、準備流程、上台、省思,囊括了很多珍貴的建議。道理真是彼此相通的,許多都和專業演講簡報課程的內容不謀而合。

2016/8/12

肺炎疫苗怎麼選?


先說結論


老人的肺炎疫苗,以 13 價結合型優先。

市面上目前有兩種肺炎鏈球菌疫苗:13 價結合型疫苗和 23 價多醣體疫苗。23 價疫苗雖然可多對抗 10 種肺炎鏈球菌,但保護效果不夠持久。

多醣體疫苗讓漿細胞(一種免疫球)釋出抗體,就像扣下槍的板機,子彈射完就沒有了;結合型疫苗則不僅射出子彈,還讓身體有能力做出新的槍,儲備未來的戰力,產生持久的免疫記憶

價格差三倍


自費接種 13 價結合型疫苗要三千多元,23 價多醣體疫苗則只要一千多元,且台灣 75 歲以上老人可以免費接種 1 劑。相對低廉的成本,有助於公衛體系推廣,這是優點。

老人免費接種肺炎疫苗,背後的推手是台塑企業的王詹樣基金會,從 2007 年起捐贈 23 價多醣體肺炎疫苗,供全台灣 75 歲以上長者接種。

兩支都接種



2016/8/11

從設計看研究


錘子科技設計總監羅子雄,在 TEDx 發表《如何成為一名優秀的設計師》


先用華麗的設計作品吸引注意,然後用自己和週遭的實例,帶出觀眾的共同困境,再用「看、想、做」三個層次,提出指引和解決辦法。很漂亮的簡報結構和呈現手法。

2016/8/10

新鮮人


在職場工作幾年後,為了打好研究基礎,重拾學生身份。



陌生又熟悉


碩士班新生訓練聽了一上午的簡介,下午和老師同學相見歡。

離開學生身份也七、八年了,這陣子再度經歷註冊、選課、健檢、新生訓練,一切有種陌生又熟悉的感覺。

然後我就變成班代了。