2016/10/5

系統性篩選疫苗期刊


新思惟醫學論文與寫作工作坊有一堂課是討論期刊的選擇策略。坦白說在這之前，我並沒有系統性分析過合適期刊，只知道幾本常見的，所以給自己這篇課後作業。

搜尋 PubMed 策略



  1. 關鍵字： "vaccine"
  2. 出版日期：近 5 年
  3. 物種：Human
  4. 語言：English
  5. 期刊分類：Core Clinical Journals，MEDLINE
  6. 年齡：成人 (19+)
本文完成時論文共計 10674 篇。但我關心的其實是有哪些期刊登了這些文章，PubMed 沒有辦法直接整理期刊名稱，要先輸出成 CSV 檔到 Excel 裡來整理比較方便。其實不難，點右上角的 "Send to"，指定要輸出 CSV 檔即可。

Excel 樞紐分析


利用 Excel 的樞紐分析功能（點選整欄／插入／樞紐分析表），統計每本期刊的出現頻率，分佈於 1537 本，前三本的總篇數佔 2303 篇 ( 21.6% )，分佈圖拖了條長尾。


排除 MMWR 和 Eurosurveillance 後，前十名如下（篇數；五年 JIF）：　
  1. Vaccine (1190; 3.338)
  2. PLOS ONE (700; 3.535)
  3. Hum Vaccin Immunother (413; 2.295)
  4. Clin Vaccine Immunol (289; 2.505)
  5. J Infect Dis (254; 5.888)
  6. BMC Infect Dis (181; 2.864)
  7. Clin Infect Dis (161; 8.880)
  8. BMC Public Health (126; 2.746)
  9. Epidemiol Infect (87; 2.562)
  10. PLoS Negl Trop Dis  (86; 4.478)


Web of Science：Compare Journals



把以上期刊全部輸入至比對介面，再點選 Select Category 就可以知道這些期刊分屬哪些領域，進一步比對五年 JIF 領域排名：

  • INFECTIOUS DISEASES: 
    • CLIN INFECT DIS (8.880; Q1; USA)
    • J INFECT DIS (5.888; Q1; USA)
    • BMC INFECT DIS (2.864; Q2; England)
    • EPIDEMIOL INFECT (2.562; Q2; England)
    • CLIN VACCINE IMMUNOL (2.505; Q2; USA)
  • IMMUNOLOGY: 
    • CLIN INFECT DIS (8.880; Q1; USA)
    • J INFECT DIS (5.888; Q1; USA)
    • VACCINE (3.338; Q2; England)
    • CLIN VACCINE IMMUNOL (2.505; Q3; USA)
    • HUM VACC IMMUNOTHER (2.295; Q3; USA)
  • MICROBIOLOGY: 
    • CLIN INFECT DIS (8.880; Q1; USA)
    • J INFECT DIS (5.888; Q1; USA)
    • CLIN VACCINE IMMUNOL (2.505; Q3; USA)
  • PUBLIC, ENVIRONMENTAL & OCCUPATIONAL HEALTH: 
    • BMC PUBLIC HEALTH (2.746; Q2; England)
    • EPIDEMIOL INFECT (2.562; Q2; England)
  • BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY: 
    • HUM VACC IMMUNOTHER (2.295; Q2; USA)
  • MULTIDISCIPLINARY SCIENCES: 
    • PLOS ONE (3.535; Q1; USA)
  • MEDICINE, RESEARCH & EXPERIMENTAL: 
    • VACCINE (3.338; Q2; England)
  • TROPICAL MEDICINE:
    • PLOS NEGLECT TROP DIS (4.478; Q1; USA)


總結


用系統性的策略，篩選出常刊登疫苗研究的期刊，並驗證品質，最大的收穫有兩個：一是整理出許多可靠的期刊，二是建立機制以後，只要換一下關鍵字，就能快速綜覽該關鍵字熱門的投稿目標。

知名的 Vaccine 排第一位、英美兩國稱霸這些都不意外；前十名有四本是 open access（PLOS x 2, BMC x 2），也意味著知識開放共享的時代來臨。

這個分析其實有些限制，比如說只知道刊登量但不知接受率（因為沒有分母）、熱門的期刊未必就適合自己的研究。但這個過程可以看出文章的集中趨勢，且挑出的期刊最佳領域排行至少都是 Q2，品質在水準之上。

後續打算整理背後的學會或出版集團、研究每本期刊屬性及接受率，找出最有歸屬感的學術社群，投注時間心力去經營。


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